KOBAS软件的使用
的有关信息介绍如下:KOBAS主要用于对基因进行KEGG注释
通过百度找到KOBAS网站
注册账户。可以不注册。但是注册之后可以保存你的输入文件和分析结果文件,有利于后面的查询。
注册之后,就可以使用用户名登陆了。当然,如果你之前已经有用该用户名进行数据的分析,那么你可以查询到你过往的数据分析结果。
基因的注释。输入的可以是基因的序列,也可以是编码蛋白的序列,也可以是NCBI上的gene ID等等。输入文件可以从已经上传到网站服务器的文件中选择,也可以直接粘贴到对话框,也可以选择新上传文件。下面的框框中选择你要比对的数据库,修改输出的文件名,点Run就可以了。
结果出来之后(如果你的序列很多的话,可能需要一天或者几天的时间,如果只有一个的话,几分钟甚至几十秒就可以了)。点击gene ID的连接,可以了解更多的情况。
Annotate + Identify中,则可以对输入序列进行注释之后,对他们进行富集聚类。方法与Annotate大同小异。
由于该网站规定最多一次注释序列500条。因此可以选择下载脚本创建本地版分析软件。